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Wheat genotyping: an invaluable service
Determinando más rápidamente el genotipo del trigo: Un servicio inestimable

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Washington, DC
August 6, 2008

ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA

By Jan Suzskiw

Helping plant breeders develop new wheat varieties with improved disease resistance, stress tolerance and other desirable traits is the goal of Agricultural Research Service (ARS) scientists based at four regional small-grains genotyping centers.

Ranked third behind corn and soybeans in planted acreage and gross receipts, wheat is a major crop used in everything from flour and baked goods to crackers and pancakes. Yet insects and diseases pose a constant threat to the crop's productivity. Fortunately, new advances in the field of genomics are speeding scientists' identification of new traits to keep wheat healthy and productive in the face of these and other threats.

For example, at the ARS Western Regional Small Grains Genotyping Laboratory in Pullman, Wash., geneticist Deven See leads a team tasked with furnishing wheat and barley breeders in five states--Washington, Oregon, California, Idaho and Montana--with genetic profiles of their germplasm materials. See estimates at least 60 percent of genotyping requests received from breeders there are for genes conferring resistance to a fungal disease called stripe rust.

In Pacific Northwest production areas, stripe rust can inflict yield losses of up to 40 percent. Conventional methods of screening germplasm for resistance genes can take months to complete. Now, thanks to the genotypic services offered by See's group, coupled with the use of a technique called marker-assisted selection, breeders can identify resistant germplasm within a few days.

At the ARS Cereal Crops Research Unit in Fargo, N.D., molecular geneticist Shiaoman Chao is building a database to store genotypic information generated at her location as well as Pullman and two other regional small-grain genotyping centers: the ARS Plant Science Research Unit in Raleigh, N.C., and the ARS Plant Science and Entomology Research Unit in Manhattan, Kan.

Among their accomplishments, Chao and colleagues have genotyped 400 single nucleotide polymorphism DNA sequence variations in a selection of elite U.S. wheat cultivars that can be linked to desirable traits in the crop, expediting breeding efforts.

Read more about the research in the August 2008 issue of Agricultural Research magazine.

ARS is a scientific research agency of the U.S. Department of Agriculture.


Determinando más rápidamente el genotipo del trigo: Un servicio inestimable

Ayudar a los criadores de plantas a desarrollar nuevas variedades de trigo con una resistencia mejorada a enfermedades, tolerancia al estrés y otras características deseables es el objetivo de los científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS) que trabajan en cuatro centros regionales de genotipificación de los granos pequeños.

Clasificado el tercero cultivo detrás del maíz y la soya en cuanto a los acres cultivados y los rendimientos brutos, el trigo es el cultivo principal usado en todo desde la harina y los productos horneados hasta las galletas secas y las crepes. Pero los insectos y las enfermedades todavía representan una amenaza constante a la productividad del trigo. Afortunadamente, nuevos adelantos en el campo de la genómica están acelerando la identificación por los científicos de las nuevas características necesitadas para mantener el trigo saludable y productivo en la presencia de estas y otras amenazas.

Por ejemplo, en el Laboratorio Regional Occidental de Genotipificación de los Granos Pequeños, mantenido por el ARS en Pullman, Washington, genetista Deven See dirige un grupo que tiene la tarea de proveerles a los criadores de trigo y cebada en cinco estados--Washington, Oregón, California, Idaho y Montana--los perfiles genéticos de sus materiales de germoplasma. See estima que por lo menos el 60 por ciento de las solicitaciones recibidas de los criadores allí para la genotipificación son relacionadas con los genes que dan resistencia a la enfermedad fúngica llamada la roya lineal amarilla.

En las áreas de producción del trigo en el Noroeste Pacífico, la roya lineal amarilla puede infligir pérdidas de rendimientos de hasta el 40 por ciento. Métodos convencionales de probar el germoplasma para genes de resistencia pueden tomar meses para terminar. Ahora, gracias a los servicios de genotipificación ofrecidos por el grupo de See, juntos con el uso de una técnica llamada la selección asistida por marcadores, los criadores pueden identificar el germoplasma resistente dentro de unos pocos días.

En la Unidad de Investigación de Cultivos Cereales mantenida por el ARS en Fargo, Dakota del Norte, genetista molecular Shiaoman Chao está construyendo una base de datos para almacenar la información genotípica generada en su laboratorio así como en Pullman y dos otros centros regionales de genotipificación de los granos pequeños: la Unidad de Investigación de Ciencia de Plantas mantenida por el ARS en Carolina del Norte, y la Unidad de Investigación de Ciencia de Plantas y Entomología mantenida por el ARS en Manhattan, Kansas.

Entre sus logros, Chao y sus colegas han determinado el genotipo de 400 variaciones en las secuencias de ADN, llamadas polimorfismos de nucleótido único, en una variedad amplia de cultivares selectos de trigo estadounidense. Estas variaciones pueden ser relacionadas con algunas características deseables en el trigo, acelerando los intentos de crianza.

Lea más sobre la investigación en la revista 'Agricultural Research' de agosto del 2008.

ARS es una agencia de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU.

 

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