home news forum careers events suppliers solutions markets expos directories catalogs resources advertise contacts
 
News Page

The news
and
beyond the news
Index of news sources
All Africa Asia/Pacific Europe Latin America Middle East North America
  Topics
  Species
Archives
News archive 1997-2008
 

Meeting at the crossroad of statistics and breeding: EUCARPIA Biometrics for Plant Breeding conference
Congres op het kruispunt van statistiek en veredeling: congres EUCARPIA Biometrics for Plant Breeding


Wageningen, The Netherlands
July 6, 2015

Meeting at the crossroad of statistics and breeding

What can you do with hundreds of mathematical equations when you need to estimate thousands of unknown variables? This might be an unsolvable puzzle according to secondary school level mathematics but the EUCARPIA Biometrics for Plant Breeding conference, from 9 to 11 September in Wageningen, gives breeders an insight into how they can use ‘Big Data’ to find a solution. 

Early registration fee until july 10th

The complete programme has been made available online today and the Early Registration Fee applies until 10 July.

“Breeding programmes have become considerably more complex due to digital phenotyping, genomics, metabolomics and epigenetics,” explains Marco Bink, co-organiser of the conference. “But they have also become more challenging and exciting.”

Big data

The conference is organised by the ‘Biometrics for Plant Breeding’ section of the European Association of Plant Breeders, EUCARPIA. “Plant breeding today is increasingly characterised by Big Data,” says Bink, expert on applying statistical methods to plant breeding data, at Wageningen UR. “It involves the phenotypic traits of plants – which breeders always had to measure – and now the huge quantities of genetic marker data as well. This does not mean that it is simply a matter of linking one dataset to the other, however. Between genes and phenotypes, issues such as gene expression, epigenetics and metabolomics – which create substantial datasets of their own – are also at play.”

Holy grail in breeding research

According to Bink, the holy grail in breeding research lies in the information that makes the need for large numbers of field trials redundant. “The trick is to predict whether a crop will do well in for example warm, dry conditions based on the genome-wide DNA profile without having to perform costly field trials with thousands of different genotypes in southern countries. In principle this type of information is hidden in the Big Data. Question is: how can the information be unlocked?”

Keynote speaker

The opening speech of the conference will be given by Netherlands-born scientist and professor Peter Visscher from the Centre for Neurogenetics & Statistical Genomics of the University of Queensland (Australia). Bink: “In his keynote lecture, Visscher will discuss how he struggles with largely the same dilemmas in human genetics. The difference is that he tries to find links between genetics and epigenetics and human health or disease.”

Research and industry

The conference will be attended by scientists from the academic field as well as those active in the industry. “I think it will be stimulating for participants from breeding practice to see how a smart setup of experiments and the intelligent use of the near infinite amount of data can be used to realise the desired steps in their breeding programmes at a faster pace.” 


Congres op het kruispunt van statistiek en veredeling

Wat doe je met honderd wiskundige vergelijkingen, wanneer je maar liefst duizend onbekende variabelen moet vinden? Volgens de wiskunde van de middelbare school zou zo’n puzzel helemaal niet op te lossen zijn. Op het congres EUCARPIA Biometrics for Plant Breeding, van 9 tot 11 september in Wageningen, kunnen onder andere veredelaars ontdekken hoe ze door slim gebruik te maken van ‘Big Data’, tóch een oplossing voor dit soort puzzels kunnen vinden.

Early bird registratie tot en met 10 juli

Vanaf vandaag staat het volledige programma online en tot en met 10 juli geldt de Early bird registratie.

"Veredelingsprogramma’s zijn door digitaal fenotyperen, genomics, metabolomics en epigenetica enorm veel complexer geworden", weet de mede-organisator van het congres, Marco Bink. "Maar daarmee is het ook enorm uitdagend."

Big Data

Het congres wordt georganiseerd door de sectie ‘Biometrics for Plant Breeding’ van de Europese Associatie van Plantenveredelaars, EUCARPIA. "De plantenveredeling van dit moment kenmerkt zich vooral door Big Data", vertelt Bink, expert op het gebied van statistische methoden voor de plantenveredeling bij Wageningen UR. "Aan de ene kant zijn dat de eigenschappen van planten die een veredelaar altijd al moest meten, maar aan de andere kant zijn daar enorme hoeveelheden genetische merkerinformatie bijgekomen. En dan nog is het geen kwestie van simpel de ene verzameling aan de andere koppelen. Tussen een gen en een eigenschap staan bijvoorbeeld ook nog de genexpressie, epigenetica en de metabolomics. Die leveren op hun beurt ook weer enorme datasets."

Heilige graal in veredelingsonderzoek

De heilige graal in het veredelingsonderzoek ligt volgens Bink in die informatie die je in staat stelt om veel veldproeven overbodig te maken. "Het is de kunst om op basis van het genoom-brede DNA profiel te voorspellen of een gewas het bijvoorbeeld goed zal doen onder warme, droge omstandigheden, zonder dat je daarvoor ook kostbare veldproeven moet doen met duizenden verschillende genotypes in zuidelijke landen. In principe ligt dat soort informatie wel in de Big Data verscholen. Alleen, hoe haal je die eruit?"

Keynote speaker

De opening van het congres wordt verzorgd door de geboren Nederlandse onderzoeker professor Peter Visscher, van het Centre for Neurogenetics & Statistical Genomics, van de universiteit van Queensland, Australië. Bink: "In zijn Keynote lecture vertelt Peter Visscher hoe hij in de humane genetica met vrijwel dezelfde dilemma’s worstelt. Alleen zoekt hij naar verbanden tussen genetica en epigenetica met gezondheid of ziekte bij de mens."

Onderzoek en bedrijfsleven

Het congres zal worden bezocht door zowel wetenschappers uit de academische wereld als ook onderzoekers uit het veredelingsbedrijfsleven. "Ik denk dat het voor de mensen uit de veredelingspraktijk vooral spannend kan zijn om te horen hoe je door een goede opzet van experimenten en vervolgens slim gebruik te maken van de bijna oneindige hoeveelheid data nog sneller de gewenste stappen kunt zetten in je veredelingsprogramma."



More news from:
    . EUCARPIA - European Association for Research on Plant Breeding
    . Wageningen University & Research


Website: http://www.eucarpia.org/

Published: July 6, 2015

The news item on this page is copyright by the organization where it originated
Fair use notice


Copyright @ 1992-2024 SeedQuest - All rights reserved