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Programme AKER - 2015, l’année de l’information génomique : générer, stocker, valoriser les données


France
November 12, 2015

Comme chaque année, AKER dévoile une partie de ses travaux à l’occasion de la réunion générale des 80 chercheurs impliqués dans le programme.

En 2015, l’accent est mis sur l’information génomique approfondie conjointement par l’INRA (Laboratoires URGI à Versailles et LIPM à Toulouse) et Florimond Desprez (Laboratoires de Biotechnologies et de Génétique et Biométrie).

Après le séquençage du génome des 15 plantes exotiques choisies dans le cadre du programme AKER, la mise au point de marqueurs moléculaires va permettre de détecter des fragments de chromosomes intéressants pour la sélection de nouvelles variétés.

L’étude du déséquilibre de liaison entre marqueurs permettra d’optimiser le génotypage et de développer de nouvelles méthodes prometteuses comme la sélection génomique.

La mise en place du système d’information AKER offrira la possibilité de collecter, stocker les données brutes puis de filtrer les données essentielles en vue de les valoriser.

Ces outils et méthodes conjuguent la biologie avec les autres disciplines telles que l’informatique ou les statistiques dans une vision transversale et collaborative. Elles génèrent des données de plus en plus nombreuses qu’il conviendra de diffuser le moment venu.

Les résultats obtenus par le génotypage et les nouvelles méthodes de sélection génomique devront être vérifiés par le phénotypage en fin de programme de manière à valider les hypothèses retenues.

AKER vise à améliorer la compétitivité de la betterave à l’horizon 2020 en doublant le rythme de croissance annuelle de son rendement en sucre/hectare (4 % vs 2 %). AKER s’inscrit dans le Programme d’Investissements d’Avenir ; il est porté par 11 partenaires publics et privés représentant l’ensemble de la filière betterave française.



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Website: http://www.aker-betterave.fr

Published: November 13, 2015


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