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June 27, 2007
ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Sharon Durham, (301) 504-1611,
sharon.durham@ars.usda.gov
The pale potato cyst nematode (Globodera pallida) has been
positively identified by Agricultural Research Service (ARS)
scientists and cooperators in soil at a potato processing plant
in eastern Idaho. This is the first time this pest--now of great
concern in Europe--has been found in the United States.
The source of the infected soil at the processing plant was
later traced to a few potato fields in Idaho, according to the
researchers with ARS and the University of Idaho.
The ARS research team in Beltsville, Md., that performed the
identification included molecular biologist Andrea Skantar in
the Molecular Plant Pathology Laboratory; and microbiologist
Zafar Handoo, plant pathologist Lynn Carta, and research leader
David Chitwood in the Nematology Laboratory.
Handoo led the morphological identification, using microscopic
examination and measurement of anatomical features that are
distinct for cysts and immature juveniles of G. pallida. Skantar
led the molecular analysis, comparing DNA from the nematode
specimens with known reference material.
Existing molecular tests are very good at distinguishing G.
pallida from golden nematode (G. rostochiensis), due to previous
research in Europe where both species are found. However,
scientists cannot readily use anatomical differences to
distinguish G. pallida from another close relative called the
tobacco cyst nematode (G. tabacum), a nematode already in the
United States. Reliable molecular tests to identify G. tabacum
have not been widely validated, largely because tobacco cyst
nematode is not widespread in Europe, where much of the prior
research has been done.
Skantar developed a new diagnostic test that may become useful
in the future, as the national survey is conducted to determine
the extent of the potential spread of the pale potato cyst
nematode. In the new assay, specific PCR primers recognize minor
differences in the DNA sequences of each nematode species,
resulting in a clear, positive test result when G. tabacum is
present.
Fields in the United States may include both G. pallida and G.
tabacum, so it is important to be able to tell these species
apart. The new test represents a proactive step aimed at
preventing diagnostic confusion as future identifications become
necessary.
ARS is the U.S. Department of Agriculture's chief scientific
research agency.
Científicos del ARS y colaboradores
identifican una plaga de la papa
Servicio Noticiero del Servicio de Investigación Agrícola
(ARS siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en inglés)
Sharon Durham, (301) 504-1611,
sharon.durham@ars.usda.gov
El nematodo del quiste de la papa (Globodera pallida) ha sido
identificado sin duda por los científicos del Servicio de
Investigación Agrícola (ARS) y colaboradores en un terreno en
una instalación de procesamiento de papas en Idaho oriental.
Esta es la primera vez que esta plaga -- ahora de gran
preocupación en Europa -- ha sido encontrada en EE.UU.
La fuente del terreno infectado en la instalación de
procesamiento fue localizada en unos pocos campos de papa en
Idaho, según los investigadores con el ARS y la Universidad de
Idaho.
El grupo de investigación del ARS en Beltsville, Maryland, que
realizó la identificación incluyó la bióloga molecular Andrea
Skantar del Laboratorio de Patología Molecular de Planta; y el
microbiólogo Zafar Handoo, la patóloga de planta Lynn Carta, y
el líder de investigación David Chitwood del Laboratorio de
Nematología.
Handoo dirigió la identificación morfológica, usando el examen
microscópico y la medida de características anatómicas que son
distintas para los quistes y juveniles inmaduros de G. pallida.
Ensayos moleculares existentes distinguen muy bien entre G.
pallida y el nematodo dorado de la papa (G. rostochiensis),
debido a investigaciones anteriores en Europa donde ambas
especies se encuentran. Sin embargo, científicos no pueden
fácilmente usar las diferencias anatómicas para distinguir entre
G. pallida y otro pariente cercano llamado el nematodo del
quiste del tabaco (G. tabacum), un nematodo ya encontrado en
EE.UU. Ensayos moleculares confiables para identificar G.
tabacum no han sido ampliamente validados, en gran parte porque
el nematodo del quiste del tabaco no se ha extendido mucho por
toda Europa, donde la mayoría de las investigaciones anteriores
han sido hechas.
Skantar desarrolló un nuevo ensayo diagnostico que podría ser
útil en el futuro, a la vez que la encuesta nacional se realiza
para determinar el alcance de la extensión potencial del
nematodo del quiste de la papa. En un nuevo ensayo, partidos
específicos de PCR reconocen las diferencias secundarias en las
secuencias de ADN de cada especie de nematodo, resultando en una
prueba positiva definitiva cuando está presente G. tabacum.
Campos en EE.UU. podrían tener ambos G. pallida y G. tabacum,
así que es importante poder distinguir entre estas especies. El
nuevo ensayo representa un paso pro activo dirigido a prevenir
la confusión diagnostica cuando identificaciones en el futuro
sean necesarias.
ARS es la agencia principal de investigaciones científicas
del Departamento de Agricultura de EE.UU. |
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